化学神笔——免费绘图软件ACD/ChemSketch 3.5
#1 一、ACD/ChemSketch 4.5简介
这是加拿大的一家专门制作各种专业化学软件的公司(Advanced Chemistry Development Inc.简称ACD)开发的免费软件,其安装文件大小为4兆多,包括几十个绘图模板与一个3D显示软件。具有以下主要功能:
结构模式:画化学结构,计算其各种属性。
绘图模式:进行文本与绘图操作。
计算分子属性:自动计算分子量、原子百分组成、克分子折射率、克分子体积、折射率、表面张力、密度、介电常数、极化率。
系统需求:
486以上PC兼容机;
VGA彩色显示器;
8.5M硬盘空间;8M以上内存。
操作系统:Windows 3.x;Windows 9x;Windows NT;
#1 二、编辑模式:结构模式与绘图模式
ChemSketch有两种模式:结构模式(Structure)与绘图模式(Draw)。在结构模式中绘制化学结构;绘图模式用来生成海报、报告与反应图等。
注意:一般先在结构模式时生成化学结构,然后在绘图模式时插入文字、箭头与图形。
运行ChemSketch 4.5后的画面(^30020501a^1):
结构模式与绘图模式均有普通工具条,位于窗口的上端,也都有状态行与调色板,位于窗口的底端。结构模式中,含有编辑分子结构工具的结构工具条位于普通工具条之下。在结构模式下,还含有原子工具条与参考工具条,分别位于窗口的左右。当从结构模式转为绘图模式时,会改变工具按钮。
注意:
●当刚运行ChemSketch 4.5时,许多菜单命令与工具按钮没有激活,一旦开始绘制分子结构,它们就可以使用了。
●若要改变结构的一些特性(例如,更粗的键位线或改变原子字母的大小),先单击选择/移动按键,然后双击要更改的分子结构部分,将会打开特性面板窗口,以做更改。任何更改只有结构中已选定的部分才生效。若想更改全部结构,注意首先选定整个分子结构,再双击此分子。
●如果一个绘制好的分子结构不能在屏幕上完全可见,单击某一个适屏键,如下:
Actual size-实际大小键 Full Page-全页显示键
Fit All-全分子结构键 Fit selected-选定结构键
ACD/ChemSketch 4.5具有极高的易用性,下面将举几个绘图与应用的实例让大家对ACD/ChemSketch有更进一步的认识:
(1)绘制简单的结构
标准绘图工具是程序启动时的缺省工具。在此模式下,你可以很容易地绘制普通分子或分支链,可以容易地用元素周期表中的原子替换已绘制好的原子。
1.确定标准绘图工具已被选定,碳原子也已被选中。用鼠标单击结构工具条上的标准绘图键及位于原子工具条上的碳原子键。
2.在绘图区单击即画出CH4。
3.在CH4上单击便增加一个CH3。
4.单击结构工具条中的设置键垂直(Set Bond Vertically)键(^30020501b^),并单击所画结构的任意一个键,便旋转为(^30020501d^2);
5.单击结构工具条中的标准绘制按键
6.单击最右面的碳原子便绘出^30020501c^3,之后便可在元素周期表(Periodic Table)中选择其它元素画出更多的分子。
注意:当你从元素周期表中选择新的元素时,相对应的按键便自动加入到原子工具条中,要从原子工具条中移去这些按键,双击它们中的任何一个或双击原子工具条,并选择YES。
(2)应用模板绘制复杂的结构,如环肽Tyr-Ala-Trp。
首先转到结构模式,先按Ctrl+A与Del键,删除以前所绘制的所有结构。
1.从模板窗口(Template Window)选择氨基酸(Amino Acids)表。
2.从氨基酸表中,选择Tyrsine,在绘图区中单击以拷贝此结构。
3.从原子基团表 中分别选择Alanine(丙胺酸)与Tryptophan(色氨酸),并在所指原子上单击以连上这些原子基团。
4.单击鼠标右键以快速转换到Select/Move模式,从NH2拖动鼠标至OH原子团,最后单击优化结构Clean Structure按键就可以得到环肽的结构图。
利用ACD/ChemSketch 3.5还可以绘制实验装置图,也可以计算分子的分子量、百分组成、摩尔折射率、摩尔量、等张比、折光系数、表面张力、密度、介电常数、极化率等宏观特性,其应用相当广泛。大家可根据介绍,一定能触类旁通,按照自己的要求,绘制出各种漂亮的化学图形与图表,应用到工作与学习中。
该软件的下载在ACD公司的网站(http://www.acdlabs.com)中,也可以到我的个人网站,“免费生物/化学软件天地”(http://biosoft.yeah.net)下载,那里还有ACD/ChemSketch3.5更详细的中文说明,和其它许多免费的生物/化学专业软件可供下载。我的E-mail地址为:biosoft@sohu.com,欢迎大家常与我联系。